中央主管機關於每年四月依直轄市、縣（市）主管機關前一年水污染防治 績效考核結果核算分配百分比（附表一），乘以當年提報水污染防治執行 計畫之重點工作預算編列情形評定之係數（附表二），據以計算次一年水 污染防治費撥交比率。

中央主管機關於直轄市、縣（市）轄區內徵收水污染防治費總額乘以前項 撥交比率核算結果，即為該直轄市、縣（市）主管機關應得之款項。