本局設下列組、室：

一、規劃組，分六科辦事。

二、土木建築組，分六科辦事。

三、機電技術組，分六科辦事。

四、工程管理組，分六科辦事。

五、營運監理組，分六科辦事。

六、產管開發組，分五科辦事。

七、秘書室，分三科辦事。

八、人事室，分二科辦事。

九、政風室。

十、主計室，分三科辦事。

十一、資訊室。

十二、法制室。