秘書處分設四科，各科掌理事項如左：

一、文書科： (一) 文書處理及行政研考等相關規章之研議事項。 (二) 公文收發、分配等事項。 (三) 公文繕校事項。 (四) 公文稽催、查詢等事項。 (五) 委員會議、業務及主管會報等議事事項。 (六) 一般性會報紀錄之整理及決議案件之通知分辦事項。 (七) 印信典守事項。 (八) 所屬機關印信之請發、核驗等事項。 (九) 行政業務研考事項。 (十) 文書資訊管理系統之處理事項。 (十一) 本會公文時效之管制事項。 (十二) 各處室登記桌之協調、管理等事項。 (十三) 其他有關文書處理及行政研考等事項。

二、事務科： (一) 營繕工程及財產物品之購置、定製、變賣、維修、驗收、登記、管 理、清點及報廢等事項。 (二) 警衛、駕駛、技工、工友之管理、訓練及考核等事項。 (三) 公務車輛之管理調派事項。 (四) 公務出國手續之洽辦事項。 (五) 水電、空調等設施之維護管理事項。 (六) 電話之裝置維修等事項。 (七) 辦公用品之保管發放等事項。 (八) 辦公廳舍之管理及環境清潔之維護事項。 (九) 消防、防空及門禁等安全管理事項。 (十) 各種集會場所之調配、佈置等事項。 (十一) 本會及所屬機關之事務工作檢核事項。 (十二) 公共關係及新聞發布事項。 (十三) 其他不屬各科掌理事項。

三、檔案科： (一) 本會檔案管理及微縮作業等相關規章之研議事項。 (二) 檔案之點收、整理、分類、立案、登記、裝訂、典藏、保護、借調 、應用及清理等事項。 (三) 公文歸檔之稽催事項。 (四) 檔案之微縮作業及其管理等事項。 (五) 微縮片之檢索、調閱及複印等事項。 (六) 檔案資訊系統之處理事項。 (七) 其他檔案管理與微縮作業等相關事項。

四、出納科： (一) 現金、票據、證券、存款、借據等件之收支、保管及移轉等事項。 (二) 現金出納帳、國庫銀行往來帳之登記、結算等事項。 (三) 本會各項證照收入之保管、解繳等事項。 (四) 發放員工薪津、差旅費、加班費等事項。 (五) 本會外匯結匯事項。 (六) 現金收支表冊之編造事項。 (七) 所得稅、代辦費及各項貸款等扣繳、申報事項。 (八) 零用金之結報、登帳等事項。 (九) 其他有關出納管理事項。