研究典藏組掌理事項如下：

一、臺灣與周邊地區史前文化、原住民、南島語族之研究、整理、典藏管理及出版。

二、國內外博物館、學校、團體之學術交流合作。

三、典藏管理規劃與藏品之徵集、入藏及登錄。

四、數位典藏管理系統之規劃與資料建置及維護。

五、標本文物之鑑定、保存、修復及諮詢服務。

六、專業圖書、期刊之徵集、典藏及服務。

七、其他有關研究典藏事項。