保育研究課掌理事項如下：

一、本區域內自然生態之保育、研究、經營、執行、監督及其成果之應用 、推廣。

二、本區域內自然資源、地形、地質、人文史蹟之調查、登錄、研究及管 理。

三、本區域內各種標本之採集、製作、研究及保管。

四、本區域內學術研究採集申請之核發及管理。

五、本區域內危害自然與人文資源案件之處理復舊及監督。

六、本區域內環境監測及保育巡查。

七、本區域內生態評估及使用之審議。

八、本區域內進入生態保護區之許可。

九、其他有關保育研究事項。