工程管理處分設五科，各科掌理事項如下：

一、第一科：

（一）行政院列管交通運輸類公共工程計畫年度作業計畫之審核。

（二）行政院列管交通運輸類公共工程計畫調整、撤銷之審查。

（三）行政院列管交通運輸類公共工程計畫執行之督導及考核。

（四）交通運輸類公共工程重要案件之追蹤、協調及配合。

（五）天然災害公共設施復建之經費審核。

（六）公共建設督導會報會議作業及其決議事項之追蹤管制。

二、第二科：

（一）行政院列管水利防洪、治山防災、能源開發、環境保護及工業等公 共工程計畫年度作業計畫之審核。

（二）由行政院列管水利防洪、治山防災、能源開發、環境保護及工業等 公共工程計畫調整、撤銷之審查。

（三）行政院列管水利防洪、治山防災、能源開發、環境保護及工業等公 共工程計畫執行之督導及考核。

（四）水利防洪、治山防災、能源開發、環境保護及工業等公共工程重要 案件之追蹤、協調及配合。

（五）天然災害公共設施復建經費之審核。

三、第三科：

（一）行政院列管公有建築、新市鎮開發及國家公園等公共工程計畫年度 作業計畫之審核。

（二）行政院列管公有建築、新市鎮開發及國家公園等公共工程計畫調整 、撤銷之審查。

（三）行政院列管公有建築、新市鎮開發及國家公園等公共工程計畫執行 之督導及考核。

（四）公有建築、新市鎮開發及國家公園等公共工程重要案件之追蹤、協 調及配合。

（五）天然災害公共設施復建經費之審核。

四、第四科：

（一）工程採購品質管理、環境保護、施工安全衛生政策與制度之研訂及 相關政令之宣導。

（二）綜理工程採購品質評鑑、抽查之執行計畫及輔導考核。

（三）工程採購品質管理、環境保護及施工安全衛生業務與人員之教育訓 練、推廣及考核。

五、第五科：

（一）行政院列管計畫管考資料之彙整及分析。

（二）公共工程統計資料相關之工程計畫管理、督導與管制考核及追蹤。

（三）公共工程計畫管理之電腦程式開發及資訊作業支援。

（四）公共工程資訊體系之建立、管理、教育訓練及推廣。

（五）公共工程計畫管理制度之研議。

（六）公共工程計畫管理綜合業務之辦理。