環境督察總隊分設七科及北、中、南區環境督察大隊，各科及各區環境督 察大隊掌理事項如下：

一、第一科： (一) 關於環境污染源抽查及複查業務之綜合規劃事項。 (二) 關於污染防治 (制) 執行之協調及監督業務之綜合規劃事項。 (三) 關於業務執行之管制考核事項。 (四) 關於業務執行之新聞協調處理及綜合性業務事項。 (五) 不屬於本總隊其他各科及各區環境督察大隊之事項。

二、第二科： (一) 關於環境影響評估書件及審查結論執行之監督事項。 (二) 關於生活環境改造計畫執行之協調及監督事項。 (三) 關於營建工地、砂石場 (車) 空氣污染管制執行之協調及監督事項 。

三、第三科： (一) 關於水質管理執行之協調及監督事項。 (二) 關於重點河川污染整治執行之協調及監督事項。 (三) 關於建築物污水處理設施之審查事項。 (四) 關於水污染防治執行之協調及監督事項。

四、第四科： (一) 關於事業廢棄物污染管制執行之協調及監督事項。 (二) 關於事業廢棄物非法棄置場址之污染調查處理事項。 (三) 關於廚餘再利用之推動及執行事項。 (四) 關於建築廢棄物與巨大家具處理之規劃、協調及監督事項。 (五) 關於公民營廢棄物清除處理機構申請案件之彙整事項。

五、第五科： (一) 關於一般廢棄物污染管制執行之協調及監督事項。 (二) 關於垃圾處理計畫執行之協調及監督事項。 (三) 關於跨區垃圾處理之協調及監督事項。 (四) 關於一般廢棄物處理場興建與營運管理計畫審查之協調及監督事項 。 (五) 關於垃圾場封閉、復育及綠 (美) 化事項。 (六) 關於河川行水區內垃圾之處理事項。

六、第六科： (一) 關於海洋污染處理之協調及監督事項。 (二) 關於毒性化學物質災害處理之協調及監督事項。 (三) 關於公害陳情及公害糾紛之通報管制事項。 (四) 關於天然災害與災後環境復建 (含飲用水水質抽驗及自來水事業災 情通報) 之協調及監督事項。 (五) 關於土壤及地下水污染緊急措施、列管與整治之協調及監督事項。 (六) 關於清潔人員安全衛生及福利事項。

七、第七科： (一) 關於環境監測調查業務綜合規劃事項。 (二) 關於河川、湖泊、水庫、海洋、土壤及地下水污染監測執行之督導 事項。 (三) 關於飲用水 (含自來水) 水質及包裝水、盛裝水水源水質稽查調查 執行之督導事項。 (四) 關於環境督察資訊系統之規劃、建制及管理維護事項。 (五) 關於地方共通性環保應用資訊系統之推廣、協助及考核事項。

八、北、中、南區環境督察大隊： (一) 第一隊： 1.關於轄區環境污染源抽查及複查業務之綜合規劃事項。 2.關於轄區污染防治 (制) 執行之協調及監督業務之綜合規劃事項 。 3.關於公害陳情、公害糾紛、海洋污染、土壤及地下水污染與其他 環境污染、毒性化學物質災害及天然災害 (含飲用水水質抽驗及 自來水事業災情通報) 之通報事項。 4.不屬於本督察大隊其他各隊之事項。 (二) 第二隊、第三隊及第四隊： 1.關於轄區空氣污染、噪音、水污染、廢棄物處理、毒性化學物質 、環境用藥之抽查及複查事項。 2.關於土壤及地下水污染緊急措施、列管及整治之配合事項。 3.關於跨直轄市、縣 (市) 環境污染源稽查及環境污染調查事項。 4.關於協同環保警察取締環保犯罪案件事項。 5.關於公害陳情、公害糾紛、海洋污染、土壤及地下水污染與其他 環境污染、毒性化學物質災害及天然災害之現場緊急處理事項。 (三) 第五隊： 1.關於污染源稽查及調查案件之樣品檢驗事項。 2.關於河川、湖泊、水庫、海洋、土壤與地下水監測之協助執行及 抽查事項。 3.關於飲用水水質與包裝水、盛裝水水源水質之稽查、調查及檢驗 事項。 4.關於實驗室各項品保、品管事項。 (四) 第六隊： 1.關於大隊各項支援稽查之行政事務事項。 2.關於大隊業務執行之管制考核事項。 3.關於大隊資訊系統之管理維護事項。 4.關於大隊其他綜合性業務之執行及管理事項。