本署設下列組、室、中心：

一、綜合規劃組，分三科辦事。

二、訓練發展組，分四科辦事。

三、就業服務組，分四科辦事。

四、身心障礙者及特定對象就業組，分四科辦事。

五、職能標準及技能檢定組，分三科辦事。

六、跨國勞動力管理組，分四科辦事。

七、秘書室，分二科辦事。

八、人事室。

九、政風室。

十、主計室，分二科辦事。

十一、資訊室。

十二、法務室。

十三、跨國勞動力事務中心，分四科辦事。

十四、勞動力發展創新中心，分二科辦事。