品種改良保護課掌理下列事項：

一、作物品種改良試驗研究。

二、作物遺傳資源試驗研究。

三、作物遺傳及育種技術研究。

四、作物抗病與抗蟲性之篩選及檢定研究。

五、植物品種權保護檢定作業之規劃及執行。

六、植物品種侵權檢定技術研發及鑑定業務之執行。

七、植物品種檢定須知及侵權鑑定作業流程之訂定。

八、其他有關品種改良及保護事項。