秘書室分設二科，各科掌理下列事項： 一、第一科： (一) 營繕工程、財物、勞務之採購及管理。 (二) 辦公廳舍及財產之管理。 (三) 車輛、油脂之管理調配及電話、水電之保養維護。 (四) 辦公廳舍安全及保全系統之監督管理。 (五) 技工、駕駛及工友之管理。 (六) 款項、票據、有價證券之收支、登記、保管及移轉。 (七) 規費、經費收繳及收支款項報表之編製。 (八) 員工薪津及其他各項所得之發放與代扣款事項彙辦。 (九) 各項所得資料彙整、申報稅款繳交及扣繳憑單填發事項。 (十) 立法院、監察院等機關之聯絡及協調。 (十一) 本局業務有關新聞與輿情資料之蒐集及分析。 (十二) 本局新聞之發布及媒體聯絡。 (十三) 人民來局陳情請願協助及協調事宜。 (十四) 其他不屬各組室主管事項。

二、第二科： (一) 文書收發分配、繕校及檔案管理。 (二) 公文檔案影像掃瞄及資料儲存事項。 (三) 公文電子傳送及交換事項。 (四) 印信典守及公文監印事項。 (五) 公文稽催及管制。 (六) 文書及檔案管理系統維護事項。 (七) 圖書雜誌與出版品之典藏及管理事項。 (八) 機要事務之處理。 (九) 其他有關文書及上級交辦事項。