秘書承長官之命處理事務，其權責如下：

一、本分局之稿之綜核及代判。

二、機密及重要文件之處理及分配。

三、各種重要會議之籌劃及參加。

四、各課室站間業務之協調。

五、分局長、副分局長不在分局時，局務之代理。

六、分層負責權責範圍內事項之決定。

七、本分局法制事項。

八、分局長、副分局交辦事項。

課長、室主任承長官之命處理事務，其權責如下：

一、主管業務之籌劃及執行。

二、工作之分配、領導及監督。

三、文稿之審核或代判。

四、主管業務報告之編擬。

五、本課室工作及權責問題之協調及解決。

六、所屬人員考核、獎懲之擬議。

七、年度工作計畫及預算之編擬。

八、關於職責上應隨時提請長官注意之事項。

九、其他交辦事項。

檢疫站主任承長官之命處理事務，其權責如下：

一、工作之分配、領導及監督。

二、文稿之審核或代判。

三、本站工作及權責問題之協調及解決。

四、所屬人員考核、獎懲之擬議。

五、年度工作計畫及預算之編擬。

六、關於職責上應隨時提請長官注意之事項。

七、其他交辦事項。

本分局處理事務，實施分層負責，逐級授權決定，其分層負責明細表另定 之。

各級主管人員對於已授權之事項，得逕行決定或代行。

各課室站處理事務，涉及其他課室站職掌者，應會商辦理；各課室站意見 不同時，陳請分局長、副分局長核定之。

各級人員因事不能執行職務或請假時，應依規定指定或委託適當人員代理 其職務，代理人就代理職務負其責任。