輔導處分設四科，各科掌理下列事項：

一、農民組織科： (一) 農會法與其子法規之擬訂及解釋事項。 (二) 農會輔導政策之擬訂、策劃及督導事項。 (三) 農會會員資格之擬訂、策劃及督導事項。 (四) 農會選舉罷免之擬訂、策劃及督導事項。 (五) 農會總幹事遴選之擬訂、策劃及督導事項。 (六) 農會人事管理之擬訂、策劃及督導事項。 (七) 農會財務輔導與檢核之擬訂、策劃及督導事項。 (八) 農會考核之擬訂、策劃及督導事項。 (九) 農會出資或投資與共同經營之擬訂、策劃及督導事項。 (十) 農會經濟事業之輔導及監督事項。 (十一) 農會振興計畫之策劃及輔導事項。 (十二) 臺灣省農會之輔導及監督事項。 (十三) 其他有關農民組織事項。

二、農業推廣科： (一) 農業推廣政策、法規之擬訂、策劃及監督事項。 (二) 農業人力政策之研擬及配合事項。 (三) 農業推廣機關 (構) 辦理農業推廣業務之輔導、監督及獎勵事項。 (四) 農業推廣人員培訓之策劃及督導事項。 (五) 農業推廣教育之策劃、協調及配合事項。 (六) 農業推廣資訊與傳播之策劃、協調及督導事項。 (七) 農村青少年推廣教育與農民終身學習之策劃、協調及監督事項。 (八) 農村家政、農家生活改善與高齡者推廣教育措施之策劃、協調及督 導事項。 (九) 農民離農轉業、創業、就業訓練之策劃及督導事項。 (十) 農業推廣設施之建置與強化服務功能之策劃及督導事項。 (十一) 輔導農會整合社區組織之策劃、協調及督導事項。 (十二) 農業財團法人之輔導及監督事項。 (十三) 其他有關農業推廣事項。

三、休閒產業科： (一) 休閒農業法規、政策之擬訂、策劃及監督事項。 (二) 休閒農業區之劃定及輔導事項。 (三) 休閒農業人才之培育及訓練事項。 (四) 休閒農業行銷之擬訂、策劃及監督事項。 (五) 休閒農場設置、輔導及監督事項。 (六) 休閒農業公共建設之策劃及輔導事項。 (七) 觀光農園、生態教育農園、市民農園等之設置、輔導及監督事項。 (八) 農業產業文化之策劃及督導事項。 (九) 地方料理與特產業務之策劃及輔導事項。 (十) 其他有關休閒產業事項。

四、農民福利科： (一) 農民福利政策、法規之擬訂、策劃、協調、督導及配合事項。 (二) 老年農民福利津貼措施之策劃及督導事項。 (三) 農村婦女權益、福利與職業能力提昇之策劃及配合事項。 (四) 農民保險之配合及督導事項。 (五) 農民子女獎助就學金之策劃及督導事項。 (六) 農業天然災害救助之策劃及督導事項。 (七) 農業保險之策劃及督導事項。 (八) 農業發展基金之策劃、運用、保管及督導事項。 (九) 其他有關農民福利事項。