軌道課掌理事項如下：

一、軌道工程、駐廠檢測、工程變更處理、廠商協調、施工及技術支援之 現場監督。

二、與其他介面工程介面整合之配合處理。

三、監造顧問執行監造之監督。

四、其他有關軌道事項。