主任工程司權責如下：

一、承處長、副處長之命，統籌督導本處各項工程建設。

二、審核各業務單位呈判（核）文稿及施工計畫、報告。

三、主管業務之規劃、推動及執行。

四、綜合文件之督導撰擬。

五、主管業務報告之編擬。

六、其他交辦事項。