棧埠管理所掌理下列事項：

一、倉棧運用及規劃事項。

二、進出口貨物進倉申請及倉位分配事項。

三、貨棧登記證之申請、變更、撤銷、換照及相關海關業務事項。

四、船舶貨物裝卸承攬業，現場工作之督導、協調及建議事項。

五、港區危險品裝卸作業管理事項。

六、倉庫設施維護及管理事項。

七、船舶加水及管理事項。

八、裝卸量統計及效率分析事項。

九、民間機具進入港區受理申請事項。

十、裝卸作業勞工安全衛生督導事項。

十一、其他交辦事項。