業務課掌理下列事項：

一、商港設施經營管理事項。

二、商港營運發展企劃事項。

三、船舶貨物裝卸承攬業、拖駁船業經營許可事項。

四、港埠業務費計收事項。

五、商港服務費收取事項。

六、旅客服務事項。

七、客戶服務事項。

八、勞工安全衛生管理、訓練宣導及職業災害處理事項。

九、辦理港埠作業委託事項。

十、專戶經理人之聯繫事項。

十一、其他交辦事項。