航政組設技術、監理、海事三科，掌理下列事項：

一、船舶檢查丈量及建造、改造船圖審核事項。

二、解體船審核事項。

三、載客船舶適航性抽查事項。

四、船舶進出港簽證事項。

五、船舶登記、註冊及監理事項。

六、船舶運送業監理事項。

七、船務出租業監理事項。

八、船務代理業監理事項。

九、海運承攬運送業監理事項。

十、貨櫃業散站經營業監理事項。

十一、打撈業管理事項。

十二、船員、引水人及動力小船駕駛人監理事項。

十三、船舶海事案件調查及海事評議事項。

十四、船舶航海及輪機記事簿核閱簽證事項。

十五、兩岸航運運輸監理事項。

十六、馬祖地區試辨兩岸通航航政監理事項。

十七、其他交辦事項。