會計室分設四科，各科掌理事項如下：

一、第一科： (一) 年度預 (概) 算、追加 (減) 預算及預算分配之籌劃、研議、分析 、編報事項。 (二) 會計單位之設置、調整及會計人員之任免、遷調、訓練、考核、獎 懲之擬議辦理事項。 (三) 其他交辦事項。

二、第二科： (一) 預算之執行、控制、保留等事項。 (二) 各項經費之核簽、收支憑證之審核，記帳憑證之編製事項。 (三) 各項採購案之會核、監辦事項。 (四) 本局財物增減之審核事項。 (五) 內部審核事項。 (六) 所屬單位會計業務之督導及考核事項。 (七) 其他交辦事項。

三、第三科： (一) 會計制度之研擬與修訂事項。 (二) 會計報告及年度決算之之編製及其他相關事項。 (三) 會計簿籍之登記與會計憑證、單據、報表及帳冊之裝訂及保管事項 。 (四) 懸帳之查催及清理事項。 (五) 上級機關查核之處理及協調事項。 (六) 銀行存款對帳單之核對及所屬單位檢查事項。 (七) 本局會計作業電腦化之研究策劃與推動實施事項。 (八) 其他交辦事項。

四、第四科： (一) 統計檔案之建立及公務統計報表之研擬事項。 (二) 各項統計資料之蒐集、審理、統計報告之會核分析及編報等事項。 (三) 收入會計業務之辦理事項。 (四) 收費票證之查驗事項。 (五) 收費業務之會核事項。 (六) 其他交辦事項。