本局氣象科技研究中心職掌如左：

一、氣象科技之研究、發展、技術轉移等事項。

二、氣象科技研究計畫之規劃、執行、管理、協調、聯繫、評估等事項。

三、技術性氣象會議之規劃及執行事項。

四、延聘國內外科技顧問之協調、聯繫、執行等事項。

五、氣象科技文獻及期刊之編印及交換事項。

六、圖書之蒐集、典藏、管理等事項。

七、大陸交通研究組氣象小組有關業務之協調及聯繫事項。

八、人才培育業務之綜合規劃及執行事項。

九、其他交辦事項。