本局第三組職掌如左：

一、水文、海洋、漁業等氣象業務之規劃及推行事項。

二、水文、海洋、漁業等氣象資料之蒐集、編輯、出版、提供等事項。

三、國內外水文及海洋氣象業務之聯繫及合作事項。

四、氣象資料處理之規劃、督導、考核等事項。

五、氣象資料之蒐集、統計、編篡、管理、供應等事項。

六、航空氣象業務之協調及聯繫事項。

七、農業氣象業務之規劃、推行、督導、考核等事項。

八、有關農業氣象資料之蒐集、編輯、出版、提供等事項。

九、農業機構之協調合作及農業氣象之推展有關事項。

十、一般及專業氣象服務之諮詢、協調、推動、督導事項。

十一、氣象展覽會之委劃及聯繫事項。

十二、其他交辦事項。