秘書室掌理事項如下：

一、飛航事故調查法令訂定、修正或廢止之研擬。

二、印信典守及文書、檔案之管理。

三、出納、財務、營繕、採購及其他事務管理。

四、國家賠償事件之處理。

五、其他有關行政管理事項。