水文技術組職掌如下：

一、地面水、地下水觀測與近海水文計畫之研擬及督導。

二、地面水、地下水與近海水文站網之建置及維護。

三、地面水、地下水與近海水文資訊之收集、分析、利用及相關法令之訂 定。

四、水文研究分析及審查。

五、地下水保育管理制度之研擬、規劃、推動及督導。

六、深層海水資源開發技術之推動。