醫務組掌理事項如下：

一、全所衛生計畫設施事項。

二、少年之健康檢查事項。

三、傳染病之預防事項。

四、少年疾病之醫治事項。

五、病室之管理事項。

六、藥品調劑、儲備及醫療器材之管理事項。

七、藥物濫用之防治及輔導等事項。

八、少年疾病、死亡之陳報及通知事項。

九、其他醫務事項。

未設醫務組者，前項業務由教導組兼辦。