後勤科掌理事項如下：

一、關於後勤政策、法規及作業程序之訂修、建議事項。

二、關於後勤施政計畫彙編審查、預算執行管制及後勤資料統計分析事項 。

三、關於國有財產產籍管理及運輸（陸運、水運、空運）業務之執行、管 制事項。

四、關於醫療保健政策修訂建議及衛生勤務管理事項。

五、關於各項後勤類裝備之規劃、管理、管制及督考事項。

六、關於車輛、武器、彈藥、機械設備、觀測器材、船艇（筏）等裝備保 修、證照異動、保險、稅金、規費之作業、執行、管制、督考等事項 。

七、關於糧秣、油料、彈藥、械彈管制作業、核生化防護裝備、服裝配賦 等之管理、管制及督考等事項。

八、關於服勤犬業務之執行、管理、管制、督考等事項。

九、關於局本部公務車輛分配及調派等管理作業事項。

十、關於本局膳食相關業務，依海岸巡防總局膳食作業手冊規定辦理。

十一、其他有關後勤裝備補給、保修事項。

十二、關於營繕工程整體規劃設計、審查、執行與督考等事項。

十三、關於後勤重要設施投資建案工作計畫編列、執行與督考等事項。

十四、關於年度營繕工程整修（建）及災害復原需求檢討、執行、管制與 督考等事項。

十五、關於水電供應等業務執行、管制與督考等事項。

十六、關於不動產管理政策、法規修正建議及不動產獲得、保管、使用維 護、處分作業計畫策訂、管制與督考等事項。

十七、關於不動產獲得（購買、撥用、徵收、接收、租賃、借用等）、管 理、使用維護、處分執行、管制與督考等事項。

十八、關於不動產陳情案件（糾紛處理）之協調與督考等事項。

十九、關於不適用營地（空置營區）管理、檢討與處理等事項。

二十、關於環保綜合業務及能源管制等事項。

二十一、其他有關土地、房建物及營繕工程管理等事項。