本細則依行政院海岸巡防署海岸巡防總局（以下簡稱本總局）組織條例第 十四條規定訂定之。

本總局處理事務，除法令另有規定外，依本細則辦理。

各組、室、中心得視業務需要，分科辦事。

總局長綜理局務，並指揮監督所屬機關及職員；副總局長襄助總局長處理 局務；其他各級主管人員各就其主管業務或奉令辦理事項，指揮監督所屬 職員辦理之。

本總局各組、室、中心（以下簡稱各單位），應依下列規定處理業務：

一、對於本總局執行法令有關事實認定之案件或行政院授權事項，應依據 本總局職權處理。

二、各單位有互相聯繫之事務，應由主辦單位會商有關單位辦理，如意見 不同，應陳主任秘書以上長官裁奪。

三、各單位制（訂）定及修正法規時，應會商各有關機關或單位擬訂，並 送秘書室企劃科審查，但情況特殊經簽請主任秘書以上長官核定者， 得免送審查。

各單位對外接洽事項，如與其他單位有關者，應事前協商，事後分別通知 。

各單位召集之會議，與其他單位或機關有關者，應將會議紀錄陳主任秘書 以上長官核閱後分送之。

各單位代表本總局出席其他機關召集會議之人員，應事先請示原則，事後 將會議情形簽報，會議結論與指示原則不符者，應即席聲明請暫為保留， 於返回本總局或以其他方式請示後，再為答覆。