反黑科掌理事項如下：

一、防制組織犯罪相關法令研修。

二、防制組織犯罪工作之規劃、督導及考核。

三、黑道、不良幫派組合活動情資蒐集之規劃、督導及考核。

四、黑道、不良幫派組合及成員調查監管之規劃、督導及考核。

五、同步掃黑行動之規劃、督導及考核。

六、檢舉黑道、不良幫派組合犯罪案件之核處。

七、黑道、不良幫派組合資料之規劃、審核及建檔。

八、遭受不法侵害行業查訪之規劃、督導及考核。

九、其他有關組織犯罪事項。