歷史真相調查組掌理事項如下：

一、歷史真相調查作業之研究、規劃及推動。

二、歷史真相調查相關報告編擬之規劃及推動。

三、應予平復司法不法之刑事有罪判決案件之研究及處理。

四、導正法治與人權教育、促進社會和解之研究、規劃及推動。

五、其他有關歷史真相調查事項。