監察調查處設下列各組；其職掌如下：

一、第一組： (一) 關於人權保障調查案件之協查事項。 (二) 關於與前目案件有關之彈劾、糾舉、糾正或該調查案件之後續核閱 、核簽或簽註意見等協助撰擬事項。 (三) 關於調查案件之登記、層轉及表報之編製等事項。 (四) 關於調查證之請領及管理事項。 (五) 關於協查人員專業訓練之計畫、執行及考核事項。 (六) 關於調查蒐證器材之登錄、管理及維護事項。 (七) 關於本處之綜合業務事項。 (八) 其他交辦事項。

二、第二組： (一) 關於內政、少數民族、司法、獄政等調查案件之協查事項。 (二) 關於與前目案件有關之彈劾、糾舉、糾正或該調查案件之後續核閱 、核簽或簽註意見等協助撰擬事項。 (三) 其他交辦事項。

三、第三組： (一) 關於財政、經濟及財產申報等調查案件之協查事項。 (二) 關於與前目案件有關之彈劾、糾舉、糾正或調查案件之後續核閱、 核簽或簽註意見等協助撰擬事項。 (三) 其他交辦事項。

四、第四組： (一) 關於交通及採購等調查案件之協查事項。 (二) 關於與前目案件有關之彈劾、糾舉、糾正或該調查案件之後續核閱 、核簽或簽註意見等協助撰擬事項。 (三) 其他交辦事項。

五、第五組： (一) 關於外交、僑政、國防、情報、教育及文化等調查案件之協查事項 。 (二) 關於與前目案件有關之彈劾、糾舉、糾正或該調查案件之後續核閱 、核簽或簽註意見等協助撰擬事項。 (三) 其他交辦事項。